Elyse Stachler, etc.,al. [預印本]牛奶中H5N1流感病毒監測方法的建立. https://doi.org/10.1101/2024.12.04.24318491
發表人:kickingbird 發表時間:2024年12月11日11点38分 來源:https://doi.org/10.1101/2024.12.04.24318491
高致病性禽流感H5N1毒株在美國奶牛中引發了多州疫情,自發病以來已在15個州蔓延,感染了數百個奶牛群。我們迅速開發並優化了基於PCR的檢測方法和測序方案,以支持H5N1分子監測。我們使用來自20個州的214種零售牛奶進行方法開發,發現數字PCR的H5N1濃度與qPCR循環阈值(Ct)值密切相關,dPCR表現出更高的敏感性。我們還發現,雜交選擇後的宏基因組測序最適合高濃度樣本,而擴增子測序最適合低濃度樣本。通過建立這些方法,我們能夠支持創建一個覆蓋馬薩諸塞州的監測計劃,每月對馬薩諸塞州所有奶牛場的散裝牛奶樣本進行檢測,這些樣本迄今為止仍為陰性。這裏描述的方法、工作流程和建議為其他旨在進行H5N1監測工作的人提供了一個框架。
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