高致病性禽流感（HPAI）病毒的2.3.4.4b分支在世界各地的野生和家禽中爆發，繼續在美國各地的奶牛、家禽和其他動物中傳播。自4月以來，美國疾病控制與預防中心通過基因組序列分析確認了66例人類病例。其中三例，在實驗室測試中發現氨基酸替代NA-S247N可能會略微降低對神經氨酸酶抑制劑奧司他韋的敏感性。美國疾病控制與預防中心還發現，從加利福尼亞州最近確診的H5N1禽流感病例中采集的病毒聚合酶酸性（PA）蛋白發生了不同的變化。
目前的疫情證實了高致病性禽流感病毒的不可預測性，因為奶牛的接觸途徑和病毒傳播方式仍然未知。在生牛奶中發現了高濃度的病毒RNA。奶牛場和家禽場的幾種動物以及越來越多的農場工人受到影響。美國農業部動植物衛生檢驗局的數據顯示，受感染奶牛、其他動物和農場工人體內的病毒密切相關。到目前為止，只有一名農場工人發現了哺乳動物適應標志物（E627K），幾乎所有農場工人都出現了輕微的眼部症狀和呼吸道症狀。盡管EpiFlu上已經提供了1000多個來自此次疫情的基因組，但缺乏及時共享從農場動物收集的可操作數據仍然是一個令人擔憂的問題。
12月28日，美國農業部公布了從生的和冷凍的貓寵物食品中收集的H5N1病毒（基因型B3.13）的樣本數據，根據俄勒岡州農業部的說法，該樣本與在食用貓寵物食品後死亡的家貓中發現的病毒在基因上相匹配。
12月30日，美國疾病控制與預防中心公布了愛荷華州和威斯康星州首例H5N1人類病例的初步樣本數據（HA和NA片段），這些數據是從接觸過受感染商業家禽的農場工人那裏收集的。此前，美國疾病控制與預防中心公布了12月11日在路易斯安那州收集的美國首例嚴重高致病性禽流感病毒病例的樣本數據，該病例與在家禽和野鳥中檢測到的D1.1基因型相同，以及華盛頓州最近的人類病例，特別是不列顛哥倫比亞省的一例嚴重人類病例。根據代表性子樣本，最新的遺傳樹分析可追溯到2024年12月30日。