2019年3月24日，一名21歲男性因發燒和咳嗽症狀住院。其咽拭子樣本於2019年3月25日被送到國家公共衛生實驗室（NPHL）- 尼泊爾國家流感中心（NIC）- 以確認疑似流感感染。同一天開始，患者接受由流行病學和疾病控制司（EDCD）提供的抗流感病毒藥物（奧司他韋）治療。該患者於2019年3月29日因呼吸系統並發症在醫院死亡。

NPHL確認患者感染甲型流感。為了確定其感染的流感病毒亞型，樣本被送到日本的NIC（世界衛生組織流感合作中心）。2019年4月30日，EDCD收到了關於日本實驗室對患者感染H5N1型甲型流感的確認信息。這是尼泊爾首次報告人感染甲型H5N1流感病例。之前，NPHL沒有報告過這種病毒感染的其他病例。