國家免疫與傳染病研究所介紹說，流感基因測序工程目標在于：針對目前人類已經的上千種人類流感和禽流感病毒進行測序，並繪制出這些病毒的基因草圖。一旦草圖繪成，流感病毒的研究資料將通過人類基因組庫，向全球科研人員公布，以幫助科研人員了解流感病毒演變、傳播以及致病機理，進而更好地開發流感疫苗。

　　據悉，流感基因測序工程將由七家科研單位共同完成。主要測序工作將由NIAID下屬的、建立在知名基因測序公司TIGR內的微生物測序中心承擔。另外，參與該工程的田納西州的一家名叫聖約的兒童研究醫院，在過去27年已收集了1.2萬份禽流感病毒樣品，這些均將用于流感基因測序工程。

　　NIAID負責人福西博士說，流感病毒是目前科學界與公共衛生領域的一項難以應付的挑戰。測序工程成果不僅是對目前流感研究有價值的科研資源，而且也可爲其他領域包括傳染病管理方面的人員提供決策參考。通過流感基因草圖資料，科研人員可以識別流感病毒的基因變化，以及解釋目前流感研究的重要問題，比如，禽流感病毒如何變化並感染人類等。