周曉明 趙慧芳 陸嘉良 潘浩 徐眉 趙根明 薑慶五 汪華. 甲型流感病毒基因變異與生存選擇壓力相關性分析. 中華傳染病雜志 2005年4期
發表人:kickingbird 發表時間:2006年5月26日16点18分 來源:中華傳染病雜志 2005年4期
目的研究甲型流感病毒基因變異與生存選擇壓力的關系,指導保守疫苗靶位點的尋找。方法選擇相同血凝素(HA)血清型具有全基因組序列的分化距離較近的多個流感病毒株系,利用Blast2程序計算各株系之間的核酸保守性、蛋白質保守性、變異核苷酸在密碼子序位中的頻率以及生存選擇壓力指數,分析與生存選擇壓力指數的相關性。結果HA基因較其他基因的核酸保守性為顯著低;HA抗原蛋白質保守性與NS基因同為較低;HA基因受生存選擇壓力作用;NS、聚合酶B1(PBl)基因受選擇壓力較小;NA、核蛋白(NP)基因受選擇壓力較大;生存選擇壓力指數與核苷酸第3密碼子位點變異頻率完全相關。結論流感病毒基因變異受複制機制形成差異和生存選擇壓力淘汰差異雙重作用影響;各基因在流感病毒生物功能中地位不同,NA、NP基因保守性較強,適宜作為疫苗靶位點候選,HA基因相比較具有一定的保守性,有望尋找到保守區段,NS、PB1基因保守性較弱,不宜作為靶位點。
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