自2021年以來，屬於H5N1分支2.3.4.4b的高致病性禽流感病毒（HPAIV）在北美野生鳥類和家禽中造成了很高的死亡率。2025年，一種新的D1.1基因型導致兩人死亡，宿主轉而飼養奶牛。然而，D1.1的進化起源和動力學尚未完全確定。在這裏，我們對17516個H5N1基因組序列的系統發育分析揭示了D1.1如何在北美H5N1流行病的抗原多樣性和生態中引入了重大轉變。D1.1是第一個主要的H5N1基因型，它（a）出現在太平洋的遷徙路線上，並且比任何先前的基因型都更快地從西向東傳播；（b）通過與北美N1片段的重組進行抗原性轉移，取代之前固定的歐亞N1；以及（c）向比迄今為止任何H5N1基因型更廣泛的宿主物種傳播，引入哺乳動物適應性。