病毒基因組的實時監測可以檢測新的變異，評估其對傳染性和疾病嚴重程度的影響，使用新的系統發育工具估計傳播率和傳播途徑，以及公共衛生當局的循證決策，但這需要及時獲取基因組信息。最新的基因組信息也有助於快速、協作和跨學科的研究以及基於證據的公共衛生應對措施（例如疫苗開發和部署）。病毒基因變化使高致病性禽流感H5N1能夠傳播給數百種鳥類和哺乳動物，導致反複的動物間傳播事件，其中包括2024年向世界衛生組織報告的72起。最近的兩份報告描述了加拿大和美國的嚴重呼吸道感染患者，他們攜帶的病毒具有多態性，這些病毒的遺傳變化以前是通過深度突變掃描預測的，以改善與人類細胞的結合。雖然這些變化可能促進了宿主病毒的複制，但H5N1的有效人際傳播尚未被觀察到。然而，這可能隨時發生變化。實時報告當前的H5N1基因組至關重要，但我們發現，從收集H5N1樣本到向全球共享所有流感數據倡議（GISAID）數據庫提交病毒數據和相關元數據之間存在長達7.5個月的延遲。
在新冠肺炎大流行早期，之前的一項研究強調了向GISAID提交SARS-CoV-2序列的長期延遲，樣本采集和提交之間平均間隔48天。這項全球分析突出了數據共享實踐快速的國家，並指出了其他落後的國家。許多國家隨後改進了數據提交管道，2024年提交給GISAID的樣本的收集到提交時間（CST）現在縮短到30天。例如，加拿大在疫情早期的CST為88天，但現在嚴重急性呼吸系統綜合征冠狀病毒2型序列的CST中位數僅為16天。在過去幾年中，這種顯著的改善有助於全球追蹤變異並監測新冠肺炎的傳播和對公共衛生的影響。