Edoardo Giussani, Alessandro Sartori, Angela Salom. FluMut:高致病性H5N1基因組突變監測工具. Virus Evolution, 2025; veaf011
發表人:kickingbird 發表時間:2025年3月13日21点27分 來源:Virus Evolution, 2025; veaf011
在過去的一個世紀裏,甲型流感病毒(IAV)導致了五次報告的流行病中的四次,所有這些流行病都源於具有禽類基因組片段的病毒。最近高致病性禽流感(HPAI)病毒的傳播,特別是分支2.3.4.4b A(H5N1)亞型,導致哺乳動物感染率驚人增加,引發了人們對未來流行病可能性的擔憂。為此,我們開發了FluMut,這是一種開源的跨平台工具,旨在識別對H5N1病毒表型有潛在影響的分子標記。FluMut利用最新的數據庫FluMutDB快速分析數千個核苷酸序列,識別與宿主適應、毒力增加和抗病毒耐藥性相關的突變。該工具既有命令行界面,也有用戶友好的圖形界面,使具有不同計算專業知識水平的研究人員都可以訪問它。FluMut提供全面的輸出,包括檢測到的標記物表、其生物學效應和相應的文獻參考。該工具填補了高致病性禽流感H5N1基因組監測中的一個關鍵空白,促進了對病毒進化的實時監測,並有助於識別可能預示大流行潛力增加的突變。未來的更新將把FluMut的功能擴展到其他流感亞型。
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