高致病性禽流感A（H5N1）病毒在加拿大卑詩省的野生鳥類和家禽中傳播。這些病毒也被認為會引起人類疾病。在這裏，我們報告了卑詩省一例由甲型H5N1流感病毒感染引起的重症病例。
2024年11月4日，一名13歲女孩因輕度哮喘病史和體重指數（體重（公斤）除以身高（米）的平方）超過35而被送往卑詩省的急診室，她雙眼有2天結膜炎病史，有1天發燒病史。她未經治療出院回家，但隨後出現咳嗽、嘔吐和腹瀉，11月7日因呼吸困難和血流動力學不穩定返回急診室。11月8日，她在接受雙水平氣道正壓通氣的同時，因呼吸衰竭、左下葉肺炎、急性腎損傷、血小板減少症和白細胞減少症被轉移到卑詩省兒童醫院的兒科重症監護室（補充附錄中的表S1，可在NEJM.org上獲得全文）。通過BioFire呼吸道病原2.1檢測（BioFire Diagnostics），入院時獲得的鼻咽拭子對甲型流感呈陽性，但對A（H1）和A（H3）呈陰性。用Xpert-Xpress CoV-2/Flu/RSV試驗（Cepheid）對樣本進行反射測試，結果顯示甲型流感PCR循環阈值（Ct）為27.1。這一發現表明病毒載量相對較高，預計會進行亞型分型；H1/H3分型鑒定陰性表明感染了新型甲型流感病毒。奧司他韋治療於11月8日開始（表S2），並實施了眼部防護、N95口罩和其他預防飛沫、接觸和空氣傳播的措施。
入院當天，針對甲型流感（H5）的逆轉錄聚合酶鏈式反應（RT-PCR）檢測呈陽性。患者有呼吸惡化的跡象——胸部X線片與急性呼吸窘迫綜合征的進展一致（圖S1）——這促使氣管插管並於11月9日開始靜脈體外膜肺氧合（ECMO）。11月10日開始持續腎髒替代治療（CRRT）。將金剛烷胺（11月9日開始）和巴洛昔韋（11月11日開始）的聯合抗病毒治療添加到正在進行的奧司他韋治療中。血液（入院時獲得的樣本）和氣管內吸出物（插管後獲得的）的細菌培養沒有生長物。
由於擔心細胞因子介導的血流動力學不穩定，從11月14日到11月16日每天進行血漿置換。一系列甲型流感特異性RT-PCR檢測顯示Ct值增加，這表明在開始抗病毒治療後不久，血清中的病毒RNA載量下降，上呼吸道和下呼吸道樣本中的病毒核糖核酸下降，11月16日首次獲得血清陰性RT-PCR結果（表1）。值得注意的是，下呼吸道標本的Ct值始終低於上呼吸道標本，這一發現表明下呼吸道的病毒水平較高（表S3）。
甲型流感（H5N1）病毒是從11月8日至11月12日期間獲得的呼吸道標本中培養出來的，但不是從隨後的呼吸道標本或任何血清標本中培養得到的（表1）。通過NA Star流感神經氨酸酶抑制劑耐藥性檢測試劑盒（ThermoFisher Scientific）的基因組分析或表型測試，在連續的呼吸道標本中沒有觀察到對治療中使用的三種抗病毒劑中任何一種的敏感性降低的證據（表1）。患者的呼吸狀態有所改善，ECMO於11月22日停止，患者的氣管於11月28日拔管。
如前所述，從11月9日（症狀發作後8天）收集的氣管吸出物樣本中獲得的病毒基因組序列被重建。該病毒被分為2.3.4.4b支系，基因型D1.1，與卑詩省同期野生鳥類中檢測到的病毒關系最密切（圖S2）。在11月9日收集的氣管吸出物樣本中檢測到對人類的適應標記：堿性聚合酶2（PB2）基因產物中檢測到E627K突變（52%等位基因頻率），對H5血凝素（HA）基因的分析在氨基酸殘基E186（根據H3成熟HA編號為E190）的密碼子中產生了模糊的調用，E186D的等位基因率為28%，Q222H的等位信號頻率為35%。H5 HA基因的突變先前已被證明可以增加與α2-6連接的唾液酸的結合，這些唾液酸是促進病毒進入人類呼吸系統細胞進行複制的受體。
在北美感染高致病性甲型H5N1禽流感病毒可導致嚴重的人類疾病。HA變化可能增加與人類呼吸道受體結合的證據令人擔憂。