美国农业部动植物卫生检验局：另一起高致病性禽流感（HPAI）从野生鸟类蔓延到奶牛的事件
发表人：kickingbird 发表时间：2025年2月8日8点4分 来源：美国农业部
背景：
2024年3月，美国农业部证实了美国奶牛群之间传播的首例高致病性禽流感病例。此前，奶制品生产商报告称，在过去的2-3个月里，他们的泌乳奶牛患上了一种不寻常的疾病。美国农业部进行的病毒全基因组测序和建模表明，高致病性禽流感H5N1，分支2.3.4.4b，基因型B3.13从野鸟到奶牛的单一溢出可能发生在2023年10月至2024年1月之间。从那时起，联邦、州和行业合作伙伴就合作应对奶牛中的高致病性禽流感威胁，从而制定了两项联邦命令并实施了国家牛奶检测战略（NMTS）。 2024年12月，各州开始加入NMTS，继续或现在实施全州散装罐监测和/或牛奶加工厂筒仓监测。内华达州是首批参与国家筒仓监测计划的州之一，该计划包括检测加工厂筒仓中的牛奶样本是否存在高致病性禽流感。这一抽样方案与美国食品药品监督管理局现有的监管计划相吻合，该计划要求在6个月内对所有A级原料奶筒仓进行四次抽样。
检测：
在内华达州，1月10日，国家兽医服务实验室（NVSL）通过聚合酶链式反应（PCR）检测到2025年1月6日和7日收集的11个筒仓样本中有3个HPAI呈阳性。该州已收到通知，并启动了调查以追踪源头，因为多达12家奶牛场（位于同一地理区域）可能向受影响的筒仓供应牛奶。1月17日，监管官员从疑似奶牛场收集了农场散装牛奶样本，并将其提交给华盛顿动物疾病诊断实验室（WADDL），该实验室是国家动物卫生实验室网络（NAHLN）的成员。1月24日星期五，NVSL通过PCR在其中两家奶牛场的样本中确认了高致病性禽流感。NVSL于1月31日完成了全基因组测序，并在一个畜群的四个不同散装罐的样本中鉴定出高致病性禽流感H5N1，分支2.3.4.4b，基因型D1.1。第二个群体也显示出与D1.1一致的部分序列。在检测之前，没有在牛身上观察到临床症状，但自那以后就有报道，受影响的乳制品生产商报告了动物奶牛场附近的大量野生鸟类死亡。
虽然在2024-2025年冬季，D1.1基因型一直是北美所有四条迁徙野鸟中传播的主要毒株，但这些内华达州的病例代表了美国奶牛中首次检测到B3.13以外的基因型，也是第二次已知的野鸟向哺乳奶牛的溢出。
病毒流行病学和起源：
自2021年底以来，已记录了六次欧亚高致病性禽流感H5N1分支2.3.4.4b在北美迁徙的野生鸟类中的单独引入（基因型A1至A6）。基因型D1.1是A3的重组体。基因型A3于2022年4月首次出现在太平洋航线上，直到2024年秋季才在太平洋航线中检测到。自今年秋天以来，通过野生鸟类监测，在所有四条迁徙路线的候鸟中零星报告了基因型A3，占迄今为止总检测量的3.3%。基因型D1.1保留了原始A3基因型的四个基因；血凝素（HA）、聚合酶碱性1（PB1）、基质（M）和非结构（NS），以及源自候鸟中发现的其他北美谱系病毒的其他基因。这种基因型于2024年9月首次被发现，并迅速扩展到所有北美迁徙路线。D1.1是目前迁徙野生鸟类中的主要基因型，尽管首次发生在2024年底，但自2022年以来占总检测量的6.07%。在内华达州奶牛中发现的D1.1病毒与最近在多条北美迁徙路线的候鸟中检测到的其他D1.1病毒密切相关。对内华达州奶牛病毒血凝素基因的分析并没有发现预测会影响对哺乳动物宿主的感染性或适应性的变化。然而，在从四只不同的奶牛身上测序的病毒中发现了PB2 D701N的变化，这通常与哺乳动物对HPAI病毒的适应有关。迄今为止，在野生鸟类或家禽中发现的D1.1病毒中没有观察到这种变化，在奶牛中检测到的B3.13基因型病毒中也没有发现这种变化。PB2 D701N以前与哺乳动物的适应有关，因为它提高哺乳动物细胞中RNA聚合酶的活性和复制效率，并有可能影响感染哺乳动物的发病机制。此前已在人类高致病性禽流感H5病例中发现了这种变化，但没有证据表明会在人类之间传播。序列中没有发现与哺乳动物适应相关的其他变化。值得注意的是，从奶牛身上测序的这些D1.1病毒不含PB2-631L标记，而PB2-631L标记似乎在奶牛B3.13序列中是固定的。根据现有的公开共享流程，NVSL立即向美国疾病控制和预防中心提供了D1.1序列信息，并将在分析后7天内将序列文件发布到国家生物技术信息中心（NCBI）序列读取档案（SRA），在根据流行病学信息解释序列和检查质量时添加元数据。
总结：
这一检测表明，这种高致病性禽流感病毒基因型D1.1是继2023年底/2024年初B3.13事件之后，候鸟向奶牛的第二次溢出事件。正在进行调查，以充分描述这一事件。内华达州农业部迅速采取行动，首先迅速加入NMTS以启动积极监测，然后在牛的迁徙可能将这种病毒进一步传播到当地以外之前，识别并隔离受影响的奶牛场。这是第一次在加工厂而不是在农场单独或直接对牛奶进行取样，检测到高后果疾病，证明筒仓监测是监测国家奶牛群高致病性禽流感的有效方法
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最近信息：
2024年3月，美国农业部证实了美国奶牛群之间传播的首例高致病性禽流感病例。此前，奶制品生产商报告称，在过去的2-3个月里，他们的泌乳奶牛患上了一种不寻常的疾病。美国农业部进行的病毒全基因组测序和建模表明，高致病性禽流感H5N1，分支2.3.4.4b，基因型B3.13从野鸟到奶牛的单一溢出可能发生在2023年10月至2024年1月之间。从那时起，联邦、州和行业合作伙伴就合作应对奶牛中的高致病性禽流感威胁，从而制定了两项联邦命令并实施了国家牛奶检测战略（NMTS）。 2024年12月，各州开始加入NMTS，继续或现在实施全州散装罐监测和/或牛奶加工厂筒仓监测。内华达州是首批参与国家筒仓监测计划的州之一，该计划包括检测加工厂筒仓中的牛奶样本是否存在高致病性禽流感。这一抽样方案与美国食品药品监督管理局现有的监管计划相吻合，该计划要求在6个月内对所有A级原料奶筒仓进行四次抽样。
检测：
在内华达州，1月10日，国家兽医服务实验室（NVSL）通过聚合酶链式反应（PCR）检测到2025年1月6日和7日收集的11个筒仓样本中有3个HPAI呈阳性。该州已收到通知，并启动了调查以追踪源头，因为多达12家奶牛场（位于同一地理区域）可能向受影响的筒仓供应牛奶。1月17日，监管官员从疑似奶牛场收集了农场散装牛奶样本，并将其提交给华盛顿动物疾病诊断实验室（WADDL），该实验室是国家动物卫生实验室网络（NAHLN）的成员。1月24日星期五，NVSL通过PCR在其中两家奶牛场的样本中确认了高致病性禽流感。NVSL于1月31日完成了全基因组测序，并在一个畜群的四个不同散装罐的样本中鉴定出高致病性禽流感H5N1，分支2.3.4.4b，基因型D1.1。第二个群体也显示出与D1.1一致的部分序列。在检测之前，没有在牛身上观察到临床症状，但自那以后就有报道，受影响的乳制品生产商报告了动物奶牛场附近的大量野生鸟类死亡。
虽然在2024-2025年冬季，D1.1基因型一直是北美所有四条迁徙野鸟中传播的主要毒株，但这些内华达州的病例代表了美国奶牛中首次检测到B3.13以外的基因型，也是第二次已知的野鸟向哺乳奶牛的溢出。
病毒流行病学和起源：
自2021年底以来，已记录了六次欧亚高致病性禽流感H5N1分支2.3.4.4b在北美迁徙的野生鸟类中的单独引入（基因型A1至A6）。基因型D1.1是A3的重组体。基因型A3于2022年4月首次出现在太平洋航线上，直到2024年秋季才在太平洋航线中检测到。自今年秋天以来，通过野生鸟类监测，在所有四条迁徙路线的候鸟中零星报告了基因型A3，占迄今为止总检测量的3.3%。基因型D1.1保留了原始A3基因型的四个基因；血凝素（HA）、聚合酶碱性1（PB1）、基质（M）和非结构（NS），以及源自候鸟中发现的其他北美谱系病毒的其他基因。这种基因型于2024年9月首次被发现，并迅速扩展到所有北美迁徙路线。D1.1是目前迁徙野生鸟类中的主要基因型，尽管首次发生在2024年底，但自2022年以来占总检测量的6.07%。在内华达州奶牛中发现的D1.1病毒与最近在多条北美迁徙路线的候鸟中检测到的其他D1.1病毒密切相关。对内华达州奶牛病毒血凝素基因的分析并没有发现预测会影响对哺乳动物宿主的感染性或适应性的变化。然而，在从四只不同的奶牛身上测序的病毒中发现了PB2 D701N的变化，这通常与哺乳动物对HPAI病毒的适应有关。迄今为止，在野生鸟类或家禽中发现的D1.1病毒中没有观察到这种变化，在奶牛中检测到的B3.13基因型病毒中也没有发现这种变化。PB2 D701N以前与哺乳动物的适应有关，因为它提高哺乳动物细胞中RNA聚合酶的活性和复制效率，并有可能影响感染哺乳动物的发病机制。此前已在人类高致病性禽流感H5病例中发现了这种变化，但没有证据表明会在人类之间传播。序列中没有发现与哺乳动物适应相关的其他变化。值得注意的是，从奶牛身上测序的这些D1.1病毒不含PB2-631L标记，而PB2-631L标记似乎在奶牛B3.13序列中是固定的。根据现有的公开共享流程，NVSL立即向美国疾病控制和预防中心提供了D1.1序列信息，并将在分析后7天内将序列文件发布到国家生物技术信息中心（NCBI）序列读取档案（SRA），在根据流行病学信息解释序列和检查质量时添加元数据。
总结：
这一检测表明，这种高致病性禽流感病毒基因型D1.1是继2023年底/2024年初B3.13事件之后，候鸟向奶牛的第二次溢出事件。正在进行调查，以充分描述这一事件。内华达州农业部迅速采取行动，首先迅速加入NMTS以启动积极监测，然后在牛的迁徙可能将这种病毒进一步传播到当地以外之前，识别并隔离受影响的奶牛场。这是第一次在加工厂而不是在农场单独或直接对牛奶进行取样，检测到高后果疾病，证明筒仓监测是监测国家奶牛群高致病性禽流感的有效方法
