239条美国H5N1分支2.3.4.4b流感病毒的基因序列
发表人:kickingbird 发表时间:2024年4月23日16点51分 来源:Andersen Laboratory at Scripps Research
美国斯克利普斯研究所的安德森实验室整理了美国农业部新上传的239条H5N1禽流感病毒序列,供全球研究者参考。具体请见该实验室的链接。
相关元数据整理列表见:https://github.com/andersen-lab/avian-influenza/blob/master/metadata/SraRunTable.csv
请注意,对疫情分析和风险评估极为重要的样本相关基础信息缺失。研究者在进行突变及进化树分析的同时对上传序列的代表性及元数据缺失等情况应有充分、客观的认识,预留政策空间并时刻关注事态发展。同时,近期感染H5N1的挤奶场工人的病毒序列并不在同一进化分支上,鉴于该工人的相关流行病学调查信息仍然缺失,希望通过现今有限的,挤牙膏式的公开数据做出准确的结论将是相当困难的。
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相关元数据整理列表见:https://github.com/andersen-lab/avian-influenza/blob/master/metadata/SraRunTable.csv
请注意,对疫情分析和风险评估极为重要的样本相关基础信息缺失。研究者在进行突变及进化树分析的同时对上传序列的代表性及元数据缺失等情况应有充分、客观的认识,预留政策空间并时刻关注事态发展。同时,近期感染H5N1的挤奶场工人的病毒序列并不在同一进化分支上,鉴于该工人的相关流行病学调查信息仍然缺失,希望通过现今有限的,挤牙膏式的公开数据做出准确的结论将是相当困难的。