高致病性禽流感（HPAI）A（H5N1）分支2.3.4.4b病毒在4头因肺炎伴全身变化而被美国农业部屠宰的奶牛中被鉴定出来。组织学检查发现3头奶牛患有支气管肺炎，1头奶牛患有栓塞性肺炎和肾炎。除了通过逆转录实时PCR在各种福尔马林固定、石蜡包埋的组织中检测高致病性禽流感A（H5N1）病毒外，还通过免疫组织化学和原位杂交在2头患有支气管肺炎的奶牛的肺呼吸道上皮和患有肾炎的奶牛的肾髓质小管中检测到甲型流感病毒。对患有支气管肺炎的奶牛进行的常见牛呼吸道病原体的PCR组合筛查显示，它们与嗜酸性组织杆菌、多杀性巴氏杆菌、溶血性曼海姆菌、牛支原体和牛冠状病毒存在多种共感染。我们描述了高致病性禽流感A（H5N1）病毒在自然感染奶牛中的分布，同时强调了研究共感染和免疫反应在流感病毒复制中的作用的必要性。