病毒基因组的实时监测可以检测新的变异，评估其对传染性和疾病严重程度的影响，使用新的系统发育工具估计传播率和传播途径，以及公共卫生当局的循证决策，但这需要及时获取基因组信息。最新的基因组信息也有助于快速、协作和跨学科的研究以及基于证据的公共卫生应对措施（例如疫苗开发和部署）。病毒基因变化使高致病性禽流感H5N1能够传播给数百种鸟类和哺乳动物，导致反复的动物间传播事件，其中包括2024年向世界卫生组织报告的72起。最近的两份报告描述了加拿大和美国的严重呼吸道感染患者，他们携带的病毒具有多态性，这些病毒的遗传变化以前是通过深度突变扫描预测的，以改善与人类细胞的结合。虽然这些变化可能促进了宿主病毒的复制，但H5N1的有效人际传播尚未被观察到。然而，这可能随时发生变化。实时报告当前的H5N1基因组至关重要，但我们发现，从收集H5N1样本到向全球共享所有流感数据倡议（GISAID）数据库提交病毒数据和相关元数据之间存在长达7.5个月的延迟。
在新冠肺炎大流行早期，之前的一项研究强调了向GISAID提交SARS-CoV-2序列的长期延迟，样本采集和提交之间平均间隔48天。这项全球分析突出了数据共享实践快速的国家，并指出了其他落后的国家。许多国家随后改进了数据提交管道，2024年提交给GISAID的样本的收集到提交时间（CST）现在缩短到30天。例如，加拿大在疫情早期的CST为88天，但现在严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型序列的CST中位数仅为16天。在过去几年中，这种显着的改善有助于全球追踪变异并监测新冠肺炎的传播和对公共卫生的影响。