大约在2005年，甲型流感病毒（IAV）再次跨越物种障碍，在犬类群体中建立了稳定的谱系。目前，禽源H3N2犬流感病毒（CIV）是唯一在犬群中稳定传播的流感毒株。最初，这种病毒仅在中国和韩国等亚洲国家被检测到。然而，在2015年，它在美国被从狗身上分离出来，随后在那里引发了大规模疫情。自最初分离以来，H3N2 CIV已被证明具有感染哺乳动物（包括猫）的能力。在整个传播过程中，该病毒不断增强了对哺乳动物宿主的适应性，构成了潜在的公共卫生威胁。为了监测H3N2 CIV在中国的流行情况，我们在2023年12月至2024年2月期间在北京、长春、沈阳、呼和浩特和云浮收集了131份有呼吸道症状的狗和猫的鼻拭子。从这些样本中，成功分离出一种流感病毒株。通过全基因组测序和系统发育分析，该菌株被鉴定为禽源H3N2 CIV。所有八个基因片段都表现出氨基酸替换，PB2 107 R N、HA1 202I和M1 227T位置与目前流行的H3N2人流感病毒（HuIV）中的位置相同。有趣的是，到2021年左右，H3N2 HuIV已经完成了PB2 107-N的替代。我们的研究表明，H3N2 CIV正朝着增强对哺乳动物宿主的适应性方向发展，强调了加强监测和风险评估的必要性。