高致病性禽流感A（H5N1）病毒在加拿大卑诗省的野生鸟类和家禽中传播。这些病毒也被认为会引起人类疾病。在这里，我们报告了卑诗省一例由甲型H5N1流感病毒感染引起的重症病例。
2024年11月4日，一名13岁女孩因轻度哮喘病史和体重指数（体重（公斤）除以身高（米）的平方）超过35而被送往卑诗省的急诊室，她双眼有2天结膜炎病史，有1天发烧病史。她未经治疗出院回家，但随后出现咳嗽、呕吐和腹泻，11月7日因呼吸困难和血流动力学不稳定返回急诊室。11月8日，她在接受双水平气道正压通气的同时，因呼吸衰竭、左下叶肺炎、急性肾损伤、血小板减少症和白细胞减少症被转移到卑诗省儿童医院的儿科重症监护室（补充附录中的表S1，可在NEJM.org上获得全文）。通过BioFire呼吸道病原2.1检测（BioFire Diagnostics），入院时获得的鼻咽拭子对甲型流感呈阳性，但对A（H1）和A（H3）呈阴性。用Xpert-Xpress CoV-2/Flu/RSV试验（Cepheid）对样本进行反射测试，结果显示甲型流感PCR循环阈值（Ct）为27.1。这一发现表明病毒载量相对较高，预计会进行亚型分型；H1/H3分型鉴定阴性表明感染了新型甲型流感病毒。奥司他韦治疗于11月8日开始（表S2），并实施了眼部防护、N95口罩和其他预防飞沫、接触和空气传播的措施。
入院当天，针对甲型流感（H5）的逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）检测呈阳性。患者有呼吸恶化的迹象——胸部X线片与急性呼吸窘迫综合征的进展一致（图S1）——这促使气管插管并于11月9日开始静脉体外膜肺氧合（ECMO）。11月10日开始持续肾脏替代治疗（CRRT）。将金刚烷胺（11月9日开始）和巴洛昔韦（11月11日开始）的联合抗病毒治疗添加到正在进行的奥司他韦治疗中。血液（入院时获得的样本）和气管内吸出物（插管后获得的）的细菌培养没有生长物。
由于担心细胞因子介导的血流动力学不稳定，从11月14日到11月16日每天进行血浆置换。一系列甲型流感特异性RT-PCR检测显示Ct值增加，这表明在开始抗病毒治疗后不久，血清中的病毒RNA载量下降，上呼吸道和下呼吸道样本中的病毒核糖核酸下降，11月16日首次获得血清阴性RT-PCR结果（表1）。值得注意的是，下呼吸道标本的Ct值始终低于上呼吸道标本，这一发现表明下呼吸道的病毒水平较高（表S3）。
甲型流感（H5N1）病毒是从11月8日至11月12日期间获得的呼吸道标本中培养出来的，但不是从随后的呼吸道标本或任何血清标本中培养得到的（表1）。通过NA Star流感神经氨酸酶抑制剂耐药性检测试剂盒（ThermoFisher Scientific）的基因组分析或表型测试，在连续的呼吸道标本中没有观察到对治疗中使用的三种抗病毒剂中任何一种的敏感性降低的证据（表1）。患者的呼吸状态有所改善，ECMO于11月22日停止，患者的气管于11月28日拔管。
如前所述，从11月9日（症状发作后8天）收集的气管吸出物样本中获得的病毒基因组序列被重建。该病毒被分为2.3.4.4b支系，基因型D1.1，与卑诗省同期野生鸟类中检测到的病毒关系最密切（图S2）。在11月9日收集的气管吸出物样本中检测到对人类的适应标记：碱性聚合酶2（PB2）基因产物中检测到E627K突变（52%等位基因频率），对H5血凝素（HA）基因的分析在氨基酸残基E186（根据H3成熟HA编号为E190）的密码子中产生了模糊的调用，E186D的等位基因率为28%，Q222H的等位信号频率为35%。H5 HA基因的突变先前已被证明可以增加与α2-6连接的唾液酸的结合，这些唾液酸是促进病毒进入人类呼吸系统细胞进行复制的受体。
在北美感染高致病性甲型H5N1禽流感病毒可导致严重的人类疾病。HA变化可能增加与人类呼吸道受体结合的证据令人担忧。