GISAID: 美國奶牛和家禽中流行的H5N1禽流感

自2024年3月以來,高致病性禽流感(HPAI)病毒的2.3.4.4億支在世界各地的野生和家禽中爆發,繼續在美國各地的奶牛場傳播,迄今已報告45例人類病例。這些高致病性禽流感病毒導致60多種哺乳動物(主要是食肉動物)在食用受感染的屍體後的發病和死亡。盡管奶牛沒有被認為有感染的風險,但美國目前的疫情表明流感仍然是不可預測的。
奶牛的接觸途徑和病毒傳播方式仍然未知。在生牛奶中發現了高濃度的病毒RNA。奶牛場和家禽場的幾種動物以及越來越多的農場工人受到影響。美國農業部動植物衛生檢驗局的數據顯示,受感染奶牛、其他動物和農場工人體內的病毒密切相關。到目前為止,只有一名農場工人發現了哺乳動物適應標志物(E627K),幾乎所有農場工人都出現了輕微的眼部症狀和呼吸道症狀。
通過GISAID EpiFlu共享了從至少18個州的哺乳動物和鳥類標本中收集的本次疫情的1000多個完整病毒基因組序列。自14日上次更新以來。11月,加拿大卑詩省疾病控制中心(BCCDC)提供了卑詩省首例人類病例的樣本數據,該病例是一名目前住院的青少年,其暴露途徑未知(EPI_ISL_19548836)。此外,加拿大食品檢驗局提供了10月20日至23日從家禽中收集的樣本數據。基於代表性子樣本的最新進化樹分析可追溯到2024年11月15日。