9月4日至5日，山東、江蘇、河南、四川、陝西、廣西、廣東、湖南、福建等多個省份報告甲型H1N1流感聚集性病例。目前，各地衛生部門均已啟動防控預案，對確診患者進行隔離治療，所有患者病情平穩。
九省份發生甲流聚集性病例
9月3日6時，山東泰安市泰山區東嶽中學發現1例甲型H1N1流感確診病例。截至4日7時，泰安市共確診甲型H1N1流感病例10例，患者全為東嶽中學學生，已全部轉到泰安市傳染病醫院隔離治療。東嶽中學南校自4日起停課一周。5日，山東省衛生廳接青島市衛生局報告，即墨市王村中學發現9例甲型H1N1流感確診病例。目前，確診患者已轉至即墨市人民醫院隔離治療，均情況穩定，無重症病例。
江蘇省衛生廳4日通報，9月1日以來，江蘇已發生4起學校甲型H1N1流感聚集性疫情。已確診的29名患者症狀較輕，均及時送定點醫院治療，沒有出現重症病例。發現發熱症狀的有120多人。這4所學校分別是：無錫市惠山區洛社雙廟初級中學；位於句容市的江蘇農林職業技術學院；江蘇科技大學張家港校區；南京市琅琊路小學。
河南省衛生廳4日晚通報稱，該省鄭州市近日先後發生三起聚集性甲型H1N1流感疫情，截至9月4日18時，三起疫情累計確診甲型H1N1流感病例40例，所有患者都已安排隔離治療，病情穩定，其中一人症狀消失。由於衛生、教育部門行動迅速，措施得力，疫情得到有效控制。這三起聚集性疫情分別為：鄭州商業技師學院確診17例，河南省實驗中學確診18例，鄭州文化綠城雙語小學確診5例。
四川省衛生廳4日通報，截至當日15時，2日發生的四川西南航空職業專修學院甲型H1N1流感疫情已確診43例，均在成都市傳染病醫院隔離治療，病情穩定，無重症病例。5日，四川自貢市、綿陽市衛生局報告兩起發生在當地學校的甲型H1N1流感疫情。確診病例5名，均為在校學生。目前，該13名確診病例已分別送往富順縣人民醫院和綿陽市傳染病醫院隔離治療，病情均穩定，無重症病例。
陝西省衛生廳5日通報，9月3日和4日，西安文理學院分別確診3例和11例甲型H1N1流感病例，4日，新增9例甲型H1N1流感確診病例，5日，再次新增6例甲型H1N1流感確診病例。至此，該院聚集性疫情確診病例數已增至29例。目前該校已經采取臨時性封校措施。
廣西自治區衛生廳4日通報北海藝術設計職業學院發生甲型H1N1流感疫情，截止9月4日17時，北海藝術設計職業學院新增發熱病例31例，累計發生發熱病例69例。目前，10例確診病例和發熱病例均已隔離治療，病情穩定，無重症病例。北海市衛生局已對密切接觸者實施隔離醫學觀察。目前該校已經停課，全體師生就地實施醫學觀察。
廣東省深圳市衛生局4日通報，該市南山區某中學和龍崗區某小學在9月3日各發現有學生出現發燒、咳嗽等症狀，經深圳市疾控部門檢測證實，為兩起學校甲型H1N1流感爆發疫情。目前，上述兩個學校共有10名學生被確診甲型H1N1流感患者，已實行居家隔離，患者病情穩定，無重症病例。
湖南省衛生廳4日通報，湖南嶽陽一所學校出現聚集性甲型流感，目前已確診2例，另有14例出現發燒等症狀。事件發生後，嶽陽市衛生部門已按照要求采取各項應急處理措施。
福建省衛生廳介紹，廈門市的福州大學工藝美術學院和廈門湖明小學4日分別出現6例、4例甲型H1N1流感確診病例。目前，10例病例均在廈門市定點醫院隔離治療，病情穩定，無重症病例。
新疆、寧夏出現首例甲流疫情
新疆維吾爾自治區衛生廳副廳長王小燕5日晚宣布，經衛生部確認，烏魯木齊新市區報告一例甲型H1N1流感確診病例，這是新疆首例甲型H1N1流感確診病例。目前，患者已在自治區傳染病醫院接受隔離治療，病情平穩。
同日，寧夏回族自治區衛生廳通報稱，寧夏報告的甲型H1N1流感疑似病例當日已被確診，這是寧夏首例輸入性確診病例。患者，男，15歲，居住於銀川市西夏區，目前在銀川某中學就讀。患者於8月14日隨團赴歐洲學習演出，30日返回銀川，31日出現發熱、咽部不適等症狀，9月3日被送往定點醫院隔離治療。目前，患者病情穩定，生命體征平穩。已追蹤到的密切接觸者正在居家隔離醫學觀察。
上海發現甲流重症病例 香港又一甲流患者死亡
上海市衛生局4日晚通報，上海市第一人民醫院南院發現一例甲型H1N1流感重症病例。這也是內地繼廣州發現首例甲流重症病例之後的第二例重症病例。上海衛生部門正全力展開救治，並對相關場所進行消毒，對患者所有密切接觸者實施居家醫學觀察和隨訪等措施。
據介紹，該名患者為男性，35歲，是外地來滬打工者。患者於一周前開始感冒，9月3日淩晨病情加重，呼吸困難，被送上海市第一人民醫院南院急診部搶救。4日被確診為甲型H1N1流感重症病例。據上海市甲流治療專家組組長盧洪洲介紹，患者的情況依然危重，有呼吸衰竭、有多器官功能衰竭，目前在盡全力搶救。
香港方面，新學年開課首日，港府衛生署即接獲12所學校爆發流感，共150人染病。香港日本人學校(中學部)和啟新書院(小學部)各有2人確診甲型流感，兩所國際學校2日起停課7天。 4日，港府衛生署建議沙田小學5日起停課7天。該校70名學生出現流感樣病征，其中4人證實感染甲型H1N1流感。5日，香港瑪嘉烈醫院宣布，4日晚有一名確診甲型H1N1流感的住院女病人死亡。