新甲型H1N1(2009)流感病毒的早期分子特征

【目的】本世紀首次流感大流行的病原屬於甲型H1N1流感病毒,在遺傳特性和抗原性等方面都有別於人群中流行多年的季節性H1N1流感病毒。為了深入了解病毒的遺傳特性,跟蹤病毒的演化趨勢,及時發現具有流行病學意義的變異株,本研究對早期分離的甲型H1N1(2009)病毒的分子特性進行了詳細分析。【方法】通過GenBank的流感資源中心下載相關毒株的基因組信息,序列分析采用DNAStar軟件包的EditSeq和MegAlign,比較與病毒致病性和宿主特異性相關的氨基酸變化情況。以A/California/07/2009(H1N1)作為新甲型H1N1(2009)的早期代表株進行詳細的分子特征分析。【結果】A/California/07/2009不具備高致病性流感病毒的分子特征;病毒編碼的11個蛋白大部分保留有豬流感病毒的分子特征,同時也具有一些禽和人流感病毒的特征;PB1-F2在11aa,57aa和87aa後發生斷裂,具有古典豬H1N1和人H1N1雙重特點,這是甲型H1N1(2009)病毒一個特有的分子特征。【結論】首次詳細分析了新甲型H1N1(2009)病毒的分子特征。隨著病毒在人群中的進一步適應和持續存在,這些分子特征...

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