廣東人禽流感H5N1 毒株M基因特性、進化和變異

通過對人禽流感H5N1 毒株M 基因序列的變異分析,揭示毒株M 基因特征與進化。檢測廣東地區人禽流感H5N1 毒株M 基因核苷酸序列,同時檢索全球人禽流感H5N1 毒株M 基因序列,采用DNAStar510 軟件對檢索的人禽流感H5N1 毒株M 基因核苷酸序列進行比對和分析;並結合流行病學資料對變異毒株進行進化速度分析。結果發現,1997~2006 年53 株毒株M1 基因和51 株毒株M2 核苷酸序列同源性均分成兩組,1997 年毒株為第一組( GⅠ) ,2003~2006 年香港、越南、泰國、印尼、中國大陸、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株為第二組( GⅡ) 。M1 基因20 個氨基酸位點置換,占7194 %(20/ 252) ,其中2003~2006 年毒株M1 基因有9 個氨基酸位點不同於1997 年毒株;M2 基因22 個氨基酸置換,占2217 %,其中2003~2006 年毒株M2 基因有4 個氨基酸不同於1997 年毒株。M2 基因Ks 值為2618 ×1026~4216 ×1026 Nt/ d ,Ka 值為4139 ×1026~6198 ×1026 Nt/ d ;而M1 基因的同義突變速度均遠高於錯義突變速度,顯示M1 基因受到機體免疫壓力較小;檢驗發現M1 基因進化存在負選擇性壓力。2003~2006 年毒株M1 基因通過氨基酸S224N 置換,增加一個糖基化位點NSS2242226 ;而來自印尼的8 株毒株M2 基因發生C50 F 置換,引起蛋白二級結構改變。1997 年中國香港人禽流感毒株自當時出現後,便未在以後人禽流感疫情中出現。2003~2006 年毒株M1 基因增加糖基化位點NSS224-226 ,可能與毒株致病性有關。人禽流感H5N1 毒株M 基因在自然界變異頻繁,可能影
響H5N1 毒株的人2人傳播能力。