H9N2亞型禽流感病毒A/Chicken/Gansu/2/99株基因組的分子特征

目的測定H9N2亞型禽流感病毒A/Chicken/Gansu/2/99(CK/GS/2/99)分離株的基因組序列並與參考毒株進行同源性分析,闡明該毒株的遺傳變異及分子特征。方法采集發病雞泄殖腔樣品,經雞胚尿囊腔接種分離病毒,采用RT-PCR方法對CK/GS/2/99株的8個分節段基因進行擴增,分別將其克隆到pGEM-T easy載體後進行序列測定與同源性分析。結果CK/GS/2/99株PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS基因的開放閱讀框分別由2280、2274、2151、1683、1497、1401、759、864個堿基組成,分別編碼759、757、716、560、498、466、252/97、231/122個氨基酸殘基。該毒株HA上HA1和HA2裂解位點序列為PARSSR↓GLF,具有典型的低致病性禽流感病毒的特征。同源性分析顯示,CK/GS/2/99株與1998-2002年間大部分中國大陸分離株遺傳關系較近,尤其與CK/NX/4/99和CK/HB/31/00株遺傳關系密切。結論CK/GS/2/99與大部分流行於中國內陸的H9N2亞型毒株均來源於共同的祖先毒株CK/BJ/...

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