全球曆年人甲型流感病毒H3A1抗原的分子進化研究

目的應用生物信息學數據庫和工具,對現有的H3N2亞型人甲型流感病毒全球分離株的H3A1抗原序列進化規律進行分析研究。方法下載NCBI Genbank和流感病毒數據庫中全部的甲型流感病毒H3A1序列,首先用兩步聚類法進行樣本拆分,隨後分類繪制出完整的進化樹。結果人H3A1序列呈現出單一主幹的進化趨勢,隨著時間的推移,進化樹結構和進化模型相關參數均呈現出一定的變化規律,關鍵變異株的出現則無明顯的地域分布特征。結論人流感病毒H3A1抗原的進化主要是病毒抗原漂移和人類免疫選擇相互作用的結果,新變異株的出現並未出現明顯的地域傾向性,中國華南地區不應當被認為是H3亞型新變異株的發源地。


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