爲了解H9N2和H5N1亞型流行性感冒病毒株的NS1基因特性,采用RT—PCR方法測定了12株2000~2003年間在華南地區分離的禽流感病毒株的NS1基因核苷酸序列,測序顯示6株H9N2亞型流感病毒NS1基因開放閱讀框(ORF)長654.bp,編碼217個氨基酸,6株H5N1亞型毒株,NS1基因ORF長678bp,編碼225個氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分析表明,同一亞型分離株之間有很高的同源性,而不同亞型的H9N2和H5N1毒株之間存在較大差異,BLAST分析表明,H5N1和H9N2亞型流感病毒分離株的NS1基因分別與近兩年從香港特區和華南地區的鴨中分離的毒株A/DucE/Hong Kong/646.3/01(H5N1)、A/Duck/Shantou/2143/01(H9N2)有很高的親緣關系,該研究結果爲進一步進行NS1功能研究奠定了基礎。
southchinaNS1-04.rar