H11型禽流感病毒（AIVs）在全球野生鳥類群體中傳播，但其進化路徑及人畜共患風險仍未得到充分描述。在本研究中，對1,179條H11血凝素（HA）序列的分析顯示，其擴散模式與歐亞遷徙鳥類航道密切相關，其中新疆被確定為季節性中轉和增殖節點。從2,674份野鳥樣本中分離出兩種病毒-K77/H11N2和BL0/H11N3（2/2674，約0.07%）。基因組分析顯示這兩種病毒均屬於歐亞野生鳥類譜系，與來自南亞、東亞、歐洲和南極的AIVs具有廣泛的相關性。HA特征顯示主要具有禽類受體親和力；值得注意的是，K77/H11N2表現出顯著的α2,3結合能力，同時具有較弱、依賴濃度的α2,6結合能力，並攜帶潛在哺乳類適應性標記PB2-I292V和NP-52H/313F，提示其在哺乳類細胞中可能具有增強的病毒適應性。這些標記在BL0/H11N3中缺失。體外和體內分析顯示，K77/H11N2具有更高的HA穩定性，在A549細胞中中等水平複制，並在小鼠中引起局部肺部炎症，而BL0/H11N3表現出有限的複制能力和極低的致病性。這兩種病毒在雞群中都實現了系統性傳播和直接接觸傳播，與家禽血清陽性率高（高達65%）相對應。在接近候鳥棲息地的農場中，在牛（3.8%）和駱駝（約2%）中檢測到抗體，為哺乳動物自然暴露於H11的罕見證據。總體而言，這項研究首次對在新疆檢測到的H11病毒進行了全面的基因組和表型特征分析，強調了一株具有有限哺乳動物適應性的H11N2毒株的出現，並突顯了在野生動物-家禽-家畜交界處強化監測的必要性。