H11型禽流感病毒（AIVs）在全球野生鳥類群體中傳播，但其進化路徑及人畜共患風險仍未得到充分描述。在本研究中，對1,179條H11血凝素（HA）序列的分析顯示，其擴散模式與歐亞遷徙鳥類航道密切相關，其中新疆被確定為季節性中轉和增殖節點。從2,674份野鳥樣本中分離出兩種病毒-K77/H11N2和BL0/H11N3（2/2674，約0.07%）。基因組分析顯示這兩種病毒均屬於歐亞野生鳥類譜系，與來自南亞、東亞、歐洲和南極的AIVs具有廣泛的相關性。HA特征顯示主要具有禽類受體親和力；值得注意的是，K77/H11N2表現出顯著的α2,3結合能力，同時具有較弱、依賴濃度的α2,6結合能力，並攜帶潛在哺乳類適應性標記PB2-I292V和NP-52H/313F，提示其在哺乳類細胞中可能具有增強的病毒適應性。這些標記在 BL0/H11N3 中缺失。體外和體內分析顯示 K77/H11N2的 HA 穩定性較高，在A549細胞中複制適中，並在小鼠肺部引起局部炎症，而BL0/H11N3的複制有限且致病性極低。兩種病毒在雞群中均可實現全身擴散和直接接觸傳播，與高家禽血清流行率（高達65%）相對應。在遷徙鳥類棲息地附近農場中，在牛（3.8%）和駱駝（約2%）中檢測到抗體，為哺乳動物自然H11暴露提供了罕見證據。總體而言，本研究首次對在新疆檢測到的 H11 病毒進行了全面的基因組和表型特征分析，強調了H11N2毒株具有有限的哺乳動物適應性，並突出了在野生動物-家禽-家畜交界處強化監測的必要性。