馬流感病毒（EIV）可以通過吸入霧化液滴、直接接觸和汙染的汙染物傳播。然而，據我們所知，沒有關於從受感染馬匹周圍的空氣中複原EIV的報告。在這裏，我們評估了是否可以通過使用空氣采樣器從實驗感染的馬的馬廄中的空氣中回收EIV。此外，我們還研究了反應時間小於30分鍾的快速分子檢測試劑盒是否可以從空氣樣本中檢測出EIV的潛在的現場應用。在單獨的馬廄裏飼養的兩匹馬被實驗性地感染了EIV。每天使用空氣采樣器收集空氣樣本，直到接種後13天（dpi）。通過實時RT-PCR在1-13dpi下從兩匹馬的28個空氣樣本中檢測到26個病毒基因。基於實時RT-PCR的快速分子檢測試劑盒在1-9和12dpi的一匹馬和1-13dpi的另一匹馬的23個空氣樣本中檢測到病毒基因。這些發現證實，感染EIV的馬將病毒釋放到空氣中。空氣采樣對人類和馬都是安全的，並且避免了在需要從未經訓練或攻擊性強的馬身上收集鼻咽拭子時造成傷害的可能性。在馬出現臨床症狀之前，通過實時RT-PCR或快速分子檢測試劑盒在空氣樣本中檢測到EIV RNA。因此，空氣采樣器可以通過在檢疫設施等地點進行常規檢測，盡早檢測到EIV RNA。