2013年宜春市甲型H1N1流感病毒分離鑒定及HA基因分子進化分析

目的 對2013年江西省宜春市甲型H1N1流感病毒HA基因序列及其編碼的氨基酸序列進行分子進化分析,為防控甲型H1N1流感大流行和常規監測提供科學根據。方法 隨機選擇11株2013年宜春市疾病預防控制中心流感監測實驗室分離到的甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒RNA,One-step RT-PCR擴增HA基因並雙向測序。以世界衛生組織疫苗推薦株A/California/07/2009(H1N1)(Gen Bank:CY121680)和幾株國內外近幾年分離的流感甲型H1N1毒株的HA基因為參考序列,采用DNAStar 7.0和Mega 5.0軟件對HA基因及其編碼的氨基酸序列進行比對,繪制分子進化樹,進行HA變異分析。結果 2013年宜春市11株所測甲型H1N1流感病毒與疫苗推薦株親緣性較近,進一步參考幾株國內外近幾年分離到的流感甲型H1N1毒株,HA沒有發生較大變異;其HA基因序列二硫鍵、糖基化位點未發生變異;盡管有7株毒株同時在抗原決定簇區A區和受體結合位點130環或其附近發生單個位點氨基酸替換變異,但未形成流行病學變異新種。結論目前的甲型H1N1流感疫苗仍對人群有保護作用,而抗原決定簇和受體結合位點的變異提示仍需要密切關注甲型H1N1流感的再次流行。

2013年宜春市甲型H1N1流感_省略_毒分離鑒定及HA基因分子進化分析_陳玉紅.pdf