GISAID: 美国奶牛和家禽中流行的H5N1禽流感

自2024年3月以来,高致病性禽流感(HPAI)病毒的2.3.4.4亿支在世界各地的野生和家禽中爆发,继续在美国各地的奶牛场传播,迄今已报告45例人类病例。这些高致病性禽流感病毒导致60多种哺乳动物(主要是食肉动物)在食用受感染的尸体后的发病和死亡。尽管奶牛没有被认为有感染的风险,但美国目前的疫情表明流感仍然是不可预测的。
奶牛的接触途径和病毒传播方式仍然未知。在生牛奶中发现了高浓度的病毒RNA。奶牛场和家禽场的几种动物以及越来越多的农场工人受到影响。美国农业部动植物卫生检验局的数据显示,受感染奶牛、其他动物和农场工人体内的病毒密切相关。到目前为止,只有一名农场工人发现了哺乳动物适应标志物(E627K),几乎所有农场工人都出现了轻微的眼部症状和呼吸道症状。
通过GISAID EpiFlu共享了从至少18个州的哺乳动物和鸟类标本中收集的本次疫情的1000多个完整病毒基因组序列。自14日上次更新以来。11月,加拿大卑诗省疾病控制中心(BCCDC)提供了卑诗省首例人类病例的样本数据,该病例是一名目前住院的青少年,其暴露途径未知(EPI_ISL_19548836)。此外,加拿大食品检验局提供了10月20日至23日从家禽中收集的样本数据。基于代表性子样本的最新进化树分析可追溯到2024年11月15日。