H5Nx高致病性禽流感病毒对家禽、野生动物及公共卫生构成持续威胁。在过去二十年中，其地理分布和宿主范围已通过迁徙网络不断扩展，近年来的监测和基因组分析显示这些网络的流行病学联系愈发明显。为阐明这些动态，我们在中国开展了长期的全国性野生鸟类监测，结合主动监测与被动监测。分析结果显示H5Nx病毒在野生鸟类中得以维持、重配并传播，凸显持续监测在捕捉病毒演化过程中的重要价值。我们识别出主要谱系之间的不同生态模式，其中2.3.4.4b谱系分布最广，是介导跨大陆传播的主要谱系。自2020年以来，中国野生鸟类中检测到的大多数2.3.4.4b病毒与起源于中国境外的谱系聚类一致，这表明这些病毒是反复重新引入的，而非在本地持续流行。这一变化强调了迁徙联系在塑造全球病毒交流中日益重要的作用，以及开展协调一致的国际主动监测的必要性。