H11型禽流感病毒（AIVs）在全球野生鸟类群体中传播，但其进化路径及人畜共患风险仍未得到充分描述。在本研究中，对1,179条H11血凝素（HA）序列的分析显示，其扩散模式与欧亚迁徙鸟类航道密切相关，其中新疆被确定为季节性中转和增殖节点。从2,674份野鸟样本中分离出两种病毒-K77/H11N2和BL0/H11N3（2/2674，约0.07%）。基因组分析显示这两种病毒均属于欧亚野生鸟类谱系，与来自南亚、东亚、欧洲和南极的AIVs具有广泛的相关性。HA特征显示主要具有禽类受体亲和力；值得注意的是，K77/H11N2表现出显着的α2,3结合能力，同时具有较弱、依赖浓度的α2,6结合能力，并携带潜在哺乳类适应性标记PB2-I292V和NP-52H/313F，提示其在哺乳类细胞中可能具有增强的病毒适应性。这些标记在 BL0/H11N3 中缺失。体外和体内分析显示 K77/H11N2的 HA 稳定性较高，在A549细胞中复制适中，并在小鼠肺部引起局部炎症，而BL0/H11N3的复制有限且致病性极低。两种病毒在鸡群中均可实现全身扩散和直接接触传播，与高家禽血清流行率（高达65%）相对应。在迁徙鸟类栖息地附近农场中，在牛（3.8%）和骆驼（约2%）中检测到抗体，为哺乳动物自然H11暴露提供了罕见证据。总体而言，本研究首次对在新疆检测到的 H11 病毒进行了全面的基因组和表型特征分析，强调了H11N2毒株具有有限的哺乳动物适应性，并突出了在野生动物-家禽-家畜交界处强化监测的必要性。