背景 尽管加强了控制措施，但全球家禽养殖场和野鸟仍持续爆发高致病性禽流感。它导致鸟类种群前所未有的死亡率，并越来越多地影响哺乳动物物种。为了有针对性地预防和控制疾病，需要更好地了解高致病性禽流感进入农场的途径。有人提出了空气传播的相关性，但涉及空气采样的研究有限，缺乏关于传播途径的明确证据。
目的 通过真核生物DNA测序对宿主材料进行表征，研究野鸟高致病性禽流感病毒是否可以通过进气口进入家禽舍。
方法 我们收集了三个受高致病性禽流感影响的家禽养殖场及其周围的颗粒物样本，这些养殖场在采样前进行了清理和净化。室内测量（n=61）直接在通过进气口进入的气流中进行，而室外空气样本（n=60）则在禽舍周围收集。从鸟类康复收容所获得了阳性对照。我们通过对18S rRNA基因扩增子进行深度测序，对环境DNA进行了元条形码编码。
结果 我们在所有三个家禽养殖场内和两个家禽养殖场外的空气中检测到水鸟DNA。在物种层面注释的序列包括天鹅和簇绒鸭。水鸟DNA存在于鸟类收容所的所有室内和室外空气样本中。
结论 受污染野鸟的空气传播物质可能通过进气口将高致病性禽流感病毒引入家禽饲养场。eDNA元条形码可以通过检测宿主来评估高致病性禽流感病毒和其他可能通过空气传播的病原体的生物安全漏洞。